眼科是集临床诊疗、教学科研于一体的现代化专业科室，专注于高原地区特殊环境下的眼病防治工作。
科室配置：科室现拥有一支技术精湛、经验丰富的医疗团队，现有主任医师1人、副主任医师2人、主治医师3人、医师1人、眼科技师2名。年门诊量近2万人次，手术量1700余台，担任各级学术委员会专委及委员10余人次。科室与四川大学华西医院眼科建立了长期深度合作关系，特邀眼科陆方教授、马麟副教授等国内知名专家作为特聘专家，定期来院开展专家门诊、疑难病例会诊及手术指导，助力学科建设、业务发展及人才培养。
先进设备：美国博士伦玻璃体切割超声乳化一体机、德国蔡司眼科手术显微镜、光学相干断层扫描仪（OCT）、高清真彩广角眼底照相机、眼底荧光造影机、眼底激光治疗机、生物测量仪、角膜地形图、角膜内皮镜等。
